La Biblioteca Satélite de Medicina nació paralelamente con la Facultad en el 2004, en cumplimiento del acuerdo marco de cooperación académica entre la Universidad de los Andes y La Fundación Santa Fe de Bogotá. La biblioteca se constituye inicialmente con las colecciones de la hemeroteca clínica de la Fundación Santa Fe de Bogotá, y se nutre con una ambiciosa adquisición de textos por compra.

En abril de 2006, la Biblioteca se trasladó al nuevo edificio del Centro de Prácticas de la Facultad de Medicina, Cra. 7 No. 116-05, 5° piso.